Lembaga Khusus & Sekolah Profesi
Lembaga Semi Otonom (LSO) dan program pelatihan spesialisasi keahlian di bawah naungan PC PMII Kota Bogor.
Lembaga Bantuan Hukum (LBH PMII)
Pusat advokasi hukum kerakyatan, pendampingan korban pelanggaran HAM, buruh, dan masyarakat rentan di Kota Bogor.
Lembaga Pers Mahasiswa (LPM PMII)
Penggerak jurnalisme warga, riset investigatif, pengelolaan redaksi web, buletin periodik, dan media pergerakan.
Pusat Studi & Kajian Kebijakan (PSKP)
Laboratorium pemikiran perumus policy brief, audit APBD Kota Bogor, dan analisis kritis tata ruang kota.
Lembaga Seni Budaya Muslimin (LESBUMI)
Pelestarian seni tradisi Sunda, sholawat, teater pergerakan, dan sastra Islam Nusantara.
Inkubator Bisnis Kader (Koperasi PMII)
Wadah kewirausahaan mahasiswa, merchandise pergerakan, dan pelatihan kemandirian ekonomi kader.
PMII Peduli & Tanggap Bencana (SIGAP)
Relawan kemanusiaan aksi cepat tanggap bencana longsor, banjir, dan bakti sosial masyarakat Kota Bogor.